Discovery Studio電腦版

Discovery Studio 2021是一款功能非常強(qiáng)大的分子建模軟件，該軟件擁有的功能十分強(qiáng)大，支持模型構(gòu)型、模型分析、科學(xué)應(yīng)用、腳本編寫、圖像分析、藥理基團(tuán)、蛋白質(zhì)建模、RL互動(dòng)、序列分析、排序、模擬以及X射線等多種的功能，但是其主要的功能就是讓用戶能夠在編輯化學(xué)教材的時(shí)候擁有超多的模型和圖紙?jiān)O(shè)計(jì)方案。它可以夠幫助用戶輕松進(jìn)行各種分子建模的工作，甚至還有效的提升了用戶的角膜效率，從而讓分子的研究更加的高效。使用它，用戶可以通過(guò)高質(zhì)量的圖形、多年專業(yè)驗(yàn)證的技術(shù)以及集成的環(huán)境，從而為用戶提供實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)保存、管理與專業(yè)水準(zhǔn)的建模，這樣就可以提高我們用戶在建模上的效率。除此之外，Discovery Studio軟件在化學(xué)方面，是可以通過(guò)數(shù)據(jù)建立分子模型，甚至還可以分析多種實(shí)驗(yàn)以及物體的結(jié)構(gòu)，完全是支持生成模型輸出到打印機(jī)上；然后在生物分析方面，也是支持將不同的基因序列放到軟件上進(jìn)行計(jì)算的，并且還可以以對(duì)比不同序列的變化，從而從而知道蛋白質(zhì)、DNA的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

Discovery Studio 2021安裝步驟：

1、在本站下載解壓文件，解壓得到Discovery Studio 2021原程序和補(bǔ)丁文件夾；

2、選擇“DS45Client.exe”開始安裝軟件，單擊“下一步”；

3、選擇自己的安裝路徑，

4、點(diǎn)擊安裝

5、安裝中，請(qǐng)稍候

6、將補(bǔ)丁文件復(fù)制到安裝路徑

7、以上就是Discovery Studio的全部安裝教程，大家可以免費(fèi)使用。

Discovery Studio 2021使用方法

1、雙擊打開軟件，如下圖

2、進(jìn)入軟件，顯示很多示例文件，這里可以點(diǎn)擊第一個(gè)Protein Structure蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看

3、如圖所示，這里就是蛋白質(zhì)的編輯樣式，如果你需要自己設(shè)計(jì)，可以從化學(xué)界面上找到模型

4、點(diǎn)擊Multiple sequence alignment功能，可以將您的多序列比對(duì)

5、提示一些關(guān)于DNA的子項(xiàng)目，可以點(diǎn)擊DNA-Single Strand查看鏈接，也可以查看不同的分子樣式

6、點(diǎn)擊Chemistry可以查看軟件的化學(xué)結(jié)構(gòu)，可以分析立體化學(xué)模型

軟件功能

1、圖形選項(xiàng)卡-圖形視圖顯示樣式對(duì)話框

“圖形視圖顯示樣式”對(duì)話框上的“圖形”選項(xiàng)卡允許您為當(dāng)前“分子窗口”設(shè)置常規(guī)圖形屬性。該選項(xiàng)卡始終可用，并且在保存文件時(shí)，此處指定的設(shè)置將與其余數(shù)據(jù)一起保存。該窗口中的設(shè)置是通過(guò)“分子窗口” |“分子窗口”訪問(wèn)的全局應(yīng)用程序設(shè)置的子集。圖形首選項(xiàng)頁(yè)面。

2、投影

這些選項(xiàng)使您可以設(shè)置兩種不同投影模式的分子顯示：

正交投影：正交投影可產(chǎn)生一個(gè)視圖，在該視圖中，對(duì)象與觀察者之間的距離無(wú)視其大小相同。正射投影通常用于工程圖形中，并具有更高的精度。

透視圖：透視圖投影會(huì)產(chǎn)生一個(gè)視圖，其中距離觀察者較遠(yuǎn)的對(duì)象看起來(lái)比靠近觀察者的對(duì)象小。這類似于人眼觀察世界和照相機(jī)產(chǎn)生照片的方式。透視投影通常通過(guò)強(qiáng)調(diào)模型的深度而非大小來(lái)提供更真實(shí)的模型表示。

角度：透視角度控制透視投影中出現(xiàn)的縮短距離。較小的角度可減小透視度，而較大的角度可增大透視度。角度限制為1到120度之間的值。默認(rèn)值為45.00°。

3、質(zhì)量

質(zhì)量設(shè)置控制用于顯示蛋白質(zhì)和DNA / RNA的3維對(duì)象的粗糙度。較低的質(zhì)量設(shè)置將通過(guò)增加粗糙度來(lái)改善渲染性能。較高的質(zhì)量設(shè)置可以改善視覺(jué)外觀。

對(duì)于常規(guī)使用，請(qǐng)選擇能夠最佳組合性能和質(zhì)量的設(shè)置。如果要導(dǎo)出圖像，請(qǐng)選擇“超高”以獲得最佳質(zhì)量。

4、背景顏色

這將打開“選擇顏色”對(duì)話框，您可以在其中選擇當(dāng)前窗口的背景色。

5、其他選擇

線寬：控制用于以線顯示樣式和單元格邊界渲染對(duì)象（例如分子）的線的粗細(xì)。

深度提示：打開時(shí)，距離觀察者較遠(yuǎn)的對(duì)象會(huì)逐漸融合到背景中，而靠近觀察者的對(duì)象將以完整，明亮的顏色顯示。通過(guò)更明亮地照亮附近的物體，而更遠(yuǎn)的物體逐漸消失在黑暗中，此功能可以更好地感覺(jué)景深。關(guān)閉深度提示后，無(wú)論物體顏色與觀察者的距離有多遠(yuǎn)，物體的顏色都將充滿而明亮。

6、原子選項(xiàng)卡-“圖形視圖顯示樣式”對(duì)話框

“ 圖形視圖顯示樣式”對(duì)話框上的“ 原子”選項(xiàng)卡控制原子和鍵的圖形表示。

7、展示風(fēng)格

無(wú)：將選定的原子空白，使其不顯示在屏幕上。您可以使用這種樣式來(lái)簡(jiǎn)化復(fù)雜的分子，方法是僅顯示感興趣的原子，或者在將蛋白質(zhì)顯示為條帶時(shí)隱藏原子。

線：使用傳統(tǒng)的線框顯示器顯示原子。未結(jié)合的原子顯示為插孔。

搖桿：使用實(shí)心圓柱體顯示粘結(jié)。非化學(xué)鍵原子顯示為千斤頂作為一個(gè) 線風(fēng)格。的棒尺寸參數(shù)改變棒的厚度。

球和棒：使用圓柱體來(lái)描述鍵，原子來(lái)描述球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定 球和桿的尺寸。

縮放的球和棒：使用圓柱體和原子進(jìn)行鍵合，并使用縮放到范德華（VDW）半徑的球。使用“ 球尺寸”和“ 桿尺寸”參數(shù)確定球和桿的尺寸。您可以通過(guò)選擇化學(xué)|自定義每個(gè)元素的默認(rèn)VDW半徑。菜單欄中的元素屬性...命令。

CPK：顯示大小與范德華（VDW）半徑相同的球。該CPK規(guī)模設(shè)定乘以VDW半徑由給定因素。您可以使用化學(xué)|自定義每個(gè)元素的默認(rèn)VDW半徑。元素屬性...命令。

多面體：顯示原子周圍的配位多面體。這種樣式主要用于材料和無(wú)機(jī)分子。該多面體風(fēng)格創(chuàng)建具有四個(gè)或更多債券的原子多面體。對(duì)聚合物的最終效果類似于鏈中的珠子。少于四個(gè)鍵的原子顯示為線，不顯示沒(méi)有鍵的原子。

8、染色

著色方式：您可以通過(guò)多種方式為原子著色?！?顏色依據(jù)”列表具有多種預(yù)定義的配色方案，包括：

元素：使用為其元素定義的顏色為每個(gè)原子著色。您可以通過(guò)選擇化學(xué)|更改基本元素的顏色。菜單欄中的元素屬性...命令。

父色：通過(guò)包含原子的父對(duì)象的顏色為每個(gè)原子著色。例如，如果氨基酸中包含原子，則該原子被氨基酸的顏色著色。

分子顏色：通過(guò)原子所屬的分子的顏色為每個(gè)原子著色。

局部電荷：通過(guò)其局部電荷為每個(gè)原子著色。顏色是從紅色（帶負(fù)電荷）到藍(lán)色（帶正電荷）的漸變中獲取的。

<其他>：根據(jù)在分子上計(jì)算出的原子和分子屬性以及模型的層次結(jié)構(gòu)，許多其他配色方案會(huì)自動(dòng)添加到可用選項(xiàng)中。這些配色方案由包含原子的層次結(jié)構(gòu)中的分子對(duì)象命名，顏色基于模型中這些對(duì)象的數(shù)量。例如， 如果加載的蛋白質(zhì)包含多條鏈，則將Molecule，AminoAcidChain和AminoAcid方案添加到顏色選項(xiàng)中。如果您使用分子方案，則分子中的所有原子都是單一顏色（通常在文檔中只有一個(gè)分子）。如果您通過(guò)AminoAcidChain著色，一條鏈中的所有原子都著色為一種顏色，而第二條鏈中的所有原子均著色為另一種顏色。

注意。數(shù)據(jù)表中包含數(shù)字的任何列都可以用作顏色標(biāo)準(zhǔn)。

顏色...：此按鈕將啟動(dòng)“ 顏色映射”對(duì)話框。

自定義：選擇單選按鈕，然后單擊顏色框以顯示“ 選擇顏色”對(duì)話框。定義顏色后，單擊“ 應(yīng)用”按鈕或“ 確定”按鈕，將自定義顏色應(yīng)用于選定的原子。

僅碳原子：選中此框可將自定義顏色僅應(yīng)用于碳原子。

9、更多控制

顯示債券定單：此復(fù)選框控制多個(gè)債券的顯示方式是否與單個(gè)債券不同。該選項(xiàng)影響Line，Stick和Ball and Stick的顯示樣式。

球尺寸，棒尺寸，CPK比例：使用這些字段可自定義比例適當(dāng)?shù)墓δ堋?

10、蛋白質(zhì)選項(xiàng)卡-圖形視圖顯示樣式對(duì)話框

該蛋白質(zhì)的圖形視圖顯示樣式對(duì)話框中的選項(xiàng)卡允許您控制的氨基酸和氨基酸鏈的表示圖形視圖。

有幾種可用的表示方式，突出顯示了蛋白質(zhì)分子的關(guān)鍵特征，以允許檢查更高級(jí)別的結(jié)構(gòu)信息。

11、其他控制

等值線：更改實(shí)體，三角形網(wǎng)格和四邊形網(wǎng)格等值面顯示的幾何形狀。

線寬：當(dāng)?shù)戎得骘@示為“ 三角形網(wǎng)格”或“ 四邊形網(wǎng)格”顯示時(shí)，控制線的粗細(xì) 。

直方圖：顯示文件中包含的等值面數(shù)據(jù)的范圍。移動(dòng)直方圖左側(cè)和右側(cè)的兩個(gè)青色滑塊，以控制光譜的分布。左側(cè)滑塊下方的值被分配為最左側(cè)的顏色。右滑塊上方的值被分配為最右邊的顏色。如果選中了“ 超出范圍限制”選項(xiàng)，則這些值將不會(huì)顯示在“分子窗口”中。

顯示框：選中此選項(xiàng)將導(dǎo)致顯示等值面的邊界框。

光譜：包含可應(yīng)用于“ 體積 等值面”顯示的各種光譜。所選光譜顯示在直方圖的底部。

帶：頻譜控制是否顯示在2， 4，8，16，32，64，或128顏色的條帶。默認(rèn)值為32。

透明度：控制體積等值面數(shù)據(jù)的透明度。向左滑動(dòng)控件，使等值面顯示更加透明。向右滑動(dòng)控件，使等值面顯示更加不透明。

剪輯超出范圍：當(dāng)直方圖中的值受到限制時(shí)，控制等值面信息的顯示。取消選中此框時(shí)，超出范圍的值分別分配為最左側(cè)和最右側(cè)。選中此框時(shí)，根本不會(huì)顯示超出范圍的值。